Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPECC1LQ69YQ0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms