Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms