Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIF1Q5UIP0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms