Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRAMEF5Q5TYX0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms