Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP2LQ5T4T6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms