Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2Q4

CCNYL2, Cyclin-Y-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL2Q5T2Q4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNYL2Q5T2Q4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNYL2Q5T2Q4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNYL2Q5T2Q4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms