Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD4BQ5PRF9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms