Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms