Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
ACSM3Q53FZ2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms