Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms