Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 251.7 ms