Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY7

LRIT3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 679 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT3Q3SXY7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRIT3Q3SXY7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
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