Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRF1Q16656 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NRF1Q16656 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NRF1Q16656 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRF1Q16656 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRF1Q16656 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRF1Q16656 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRF1Q16656 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRF1Q16656 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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NRF1Q16656 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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NRF1Q16656 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRF1Q16656 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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NRF1Q16656 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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NRF1Q16656 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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NRF1Q16656 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRF1Q16656 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRF1Q16656 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRF1Q16656 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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NRF1Q16656 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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NRF1Q16656 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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NRF1Q16656 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRF1Q16656 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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NRF1Q16656 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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NRF1Q16656 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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NRF1Q16656 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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NRF1Q16656 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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