Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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