Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACKR1Q16570 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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