Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRA6Q16445 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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