Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PRR4Q16378 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PRR4Q16378 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms