Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NTRK3Q16288 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
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