Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEBPEQ15744 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEBPEQ15744 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms