Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNHIT3Q15649 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
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