Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PUM3Q15397 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
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