Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCF4Q15080 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCF4Q15080 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCF4Q15080 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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