Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HERC3Q15034 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
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