Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
R3HDM1Q15032 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
R3HDM1Q15032 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
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