Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MDC1Q14676 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDC1Q14676 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDC1Q14676 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDC1Q14676 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDC1Q14676 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDC1Q14676 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDC1Q14676 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDC1Q14676 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDC1Q14676 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDC1Q14676 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDC1Q14676 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDC1Q14676 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDC1Q14676 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDC1Q14676 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDC1Q14676 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDC1Q14676 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDC1Q14676 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDC1Q14676 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDC1Q14676 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDC1Q14676 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDC1Q14676 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDC1Q14676 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDC1Q14676 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MDC1Q14676 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDC1Q14676 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDC1Q14676 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDC1Q14676 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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