Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBR1Q14596 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBR1Q14596 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBR1Q14596 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBR1Q14596 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NBR1Q14596 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBR1Q14596 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBR1Q14596 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBR1Q14596 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBR1Q14596 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBR1Q14596 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBR1Q14596 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBR1Q14596 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBR1Q14596 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms