Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
COL9A3Q14050 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
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