Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA3CQ13748 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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