Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PEX6Q13608 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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