Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms