Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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