Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PKD2Q13563 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PKD2Q13563 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PKD2Q13563 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PKD2Q13563 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PKD2Q13563 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PKD2Q13563 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
PKD2Q13563 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PKD2Q13563 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PKD2Q13563 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PKD2Q13563 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PKD2Q13563 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PKD2Q13563 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PKD2Q13563 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PKD2Q13563 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PKD2Q13563 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PKD2Q13563 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PKD2Q13563 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PKD2Q13563 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PKD2Q13563 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PKD2Q13563 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PKD2Q13563 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PKD2Q13563 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PKD2Q13563 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PKD2Q13563 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PKD2Q13563 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PKD2Q13563 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
PKD2Q13563 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PKD2Q13563 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
PKD2Q13563 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PKD2Q13563 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PKD2Q13563 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PKD2Q13563 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PKD2Q13563 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
PKD2Q13563 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PKD2Q13563 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PKD2Q13563 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PKD2Q13563 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PKD2Q13563 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PKD2Q13563 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PKD2Q13563 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PKD2Q13563 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PKD2Q13563 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PKD2Q13563 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PKD2Q13563 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PKD2Q13563 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PKD2Q13563 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PKD2Q13563 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PKD2Q13563 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PKD2Q13563 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PKD2Q13563 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PKD2Q13563 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
PKD2Q13563 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
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