Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRQ13535 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRQ13535 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRQ13535 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRQ13535 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRQ13535 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRQ13535 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRQ13535 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRQ13535 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRQ13535 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRQ13535 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRQ13535 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRQ13535 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRQ13535 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRQ13535 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRQ13535 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRQ13535 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRQ13535 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRQ13535 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRQ13535 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRQ13535 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRQ13535 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRQ13535 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRQ13535 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRQ13535 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRQ13535 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRQ13535 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATRQ13535 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATRQ13535 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATRQ13535 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATRQ13535 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATRQ13535 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATRQ13535 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATRQ13535 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATRQ13535 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRQ13535 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRQ13535 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRQ13535 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRQ13535 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRQ13535 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRQ13535 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRQ13535 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRQ13535 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRQ13535 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRQ13535 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRQ13535 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRQ13535 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRQ13535 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRQ13535 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRQ13535 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRQ13535 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRQ13535 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRQ13535 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRQ13535 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRQ13535 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRQ13535 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRQ13535 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRQ13535 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRQ13535 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRQ13535 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRQ13535 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRQ13535 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRQ13535 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRQ13535 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRQ13535 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRQ13535 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRQ13535 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRQ13535 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRQ13535 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRQ13535 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRQ13535 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRQ13535 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRQ13535 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRQ13535 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRQ13535 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRQ13535 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRQ13535 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRQ13535 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRQ13535 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRQ13535 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRQ13535 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRQ13535 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRQ13535 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRQ13535 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRQ13535 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRQ13535 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRQ13535 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRQ13535 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRQ13535 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRQ13535 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATRQ13535 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ATRQ13535 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATRQ13535 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATRQ13535 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATRQ13535 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRQ13535 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRQ13535 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRQ13535 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRQ13535 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRQ13535 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
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