Protein–RNA interactions for Protein: Q13349

ITGAD, Integrin alpha-D, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGADQ13349 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGADQ13349 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGADQ13349 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGADQ13349 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGADQ13349 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGADQ13349 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGADQ13349 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGADQ13349 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGADQ13349 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGADQ13349 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGADQ13349 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGADQ13349 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGADQ13349 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGADQ13349 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGADQ13349 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGADQ13349 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGADQ13349 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGADQ13349 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGADQ13349 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGADQ13349 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGADQ13349 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGADQ13349 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGADQ13349 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGADQ13349 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGADQ13349 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGADQ13349 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGADQ13349 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGADQ13349 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGADQ13349 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGADQ13349 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGADQ13349 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGADQ13349 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGADQ13349 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGADQ13349 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGADQ13349 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGADQ13349 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGADQ13349 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGADQ13349 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGADQ13349 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGADQ13349 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGADQ13349 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGADQ13349 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGADQ13349 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGADQ13349 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGADQ13349 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGADQ13349 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITGADQ13349 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGADQ13349 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGADQ13349 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGADQ13349 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGADQ13349 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGADQ13349 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGADQ13349 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGADQ13349 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGADQ13349 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGADQ13349 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGADQ13349 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGADQ13349 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGADQ13349 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGADQ13349 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGADQ13349 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGADQ13349 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGADQ13349 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGADQ13349 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGADQ13349 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGADQ13349 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGADQ13349 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITGADQ13349 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGADQ13349 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGADQ13349 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGADQ13349 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGADQ13349 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGADQ13349 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGADQ13349 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGADQ13349 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGADQ13349 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGADQ13349 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGADQ13349 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGADQ13349 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGADQ13349 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGADQ13349 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGADQ13349 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGADQ13349 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGADQ13349 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGADQ13349 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGADQ13349 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGADQ13349 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGADQ13349 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGADQ13349 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGADQ13349 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGADQ13349 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGADQ13349 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITGADQ13349 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGADQ13349 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGADQ13349 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGADQ13349 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGADQ13349 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGADQ13349 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGADQ13349 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGADQ13349 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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