Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.324e-8■■■■■ 35.4
PABPC4Q13310 NECAB3-213ENST00000488489 2142 ntTSL 222.54■■□□□ 1.24e-8■■■■■ 35.4
PABPC4Q13310 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.034e-8■■■■■ 35.4
PABPC4Q13310 NECAB3-218ENST00000606525 2010 ntTSL 220.6■□□□□ 0.894e-8■■■■■ 35.4
PABPC4Q13310 NECAB3-206ENST00000477778 462 ntTSL 314.8□□□□□ -0.044e-8■■■■■ 35.4
PABPC4Q13310 STARD10-204ENST00000535075 526 ntTSL 219.5■□□□□ 0.718e-7■■■■■ 35.4
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PABPC4Q13310 SFXN5-201ENST00000272433 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.422e-12■■■■■ 35.4
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PABPC4Q13310 NDUFB7-202ENST00000593353 529 ntTSL 218.95■□□□□ 0.627e-40■■■■■ 35.2
PABPC4Q13310 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.163e-27■■■■■ 35.2
PABPC4Q13310 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.383e-7■■■■■ 35.2
PABPC4Q13310 NPC2-208ENST00000556009 699 ntTSL 521.69■■□□□ 1.063e-7■■■■■ 35.2
PABPC4Q13310 NPC2-205ENST00000554482 583 ntTSL 213.72□□□□□ -0.213e-7■■■■■ 35.2
PABPC4Q13310 NPC2-202ENST00000434013 875 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.333e-7■■■■■ 35.2
PABPC4Q13310 NPC2-201ENST00000238633 796 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.553e-7■■■■■ 35.2
PABPC4Q13310 NPC2-209ENST00000557510 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.653e-7■■■■■ 35.2
PABPC4Q13310 NPC2-204ENST00000553490 729 ntTSL 210.58□□□□□ -0.723e-7■■■■■ 35.2
PABPC4Q13310 NPC2-203ENST00000541064 1436 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.793e-7■■■■■ 35.2
PABPC4Q13310 FAM45A-205ENST00000487888 851 ntTSL 219.42■□□□□ 0.74e-6■■■■■ 35.2
PABPC4Q13310 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.374e-6■■■■■ 35.2
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PABPC4Q13310 FAM45A-208ENST00000493766 824 ntTSL 317.3■□□□□ 0.364e-6■■■■■ 35.2
PABPC4Q13310 FAM45A-204ENST00000472379 984 ntTSL 216.23■□□□□ 0.194e-6■■■■■ 35.2
PABPC4Q13310 NFIA-207ENST00000403491 9487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 35.2
PABPC4Q13310 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.394e-8■■■■■ 35.1
PABPC4Q13310 CDK6-201ENST00000265734 11612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.656e-9■■■■■ 35.1
PABPC4Q13310 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.782e-7■■■■■ 35.1
PABPC4Q13310 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.032e-7■■■■■ 35.1
PABPC4Q13310 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.332e-7■■■■■ 35.1
PABPC4Q13310 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.682e-7■■■■■ 35.1
PABPC4Q13310 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 35.1
PABPC4Q13310 ID2-204ENST00000472142 474 ntTSL 27.32□□□□□ -1.242e-7■■■■■ 35.1
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PABPC4Q13310 HINT2-202ENST00000461169 734 ntTSL 227.43■■□□□ 1.985e-10■■■■■ 35.1
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PABPC4Q13310 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.183e-15■■■■■ 35.1
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PABPC4Q13310 C7orf43-208ENST00000470260 1103 ntTSL 221.68■■□□□ 1.063e-15■■■■■ 35.1
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PABPC4Q13310 C7orf43-202ENST00000394035 1255 ntTSL 1 (best)17.6■□□□□ 0.413e-15■■■■■ 35.1
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PABPC4Q13310 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.051e-6■■■■■ 35.1
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PABPC4Q13310 LYZ-201ENST00000261267 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.82e-9■■■■■ 35
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PABPC4Q13310 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.393e-14■■■■■ 35
PABPC4Q13310 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.313e-14■■■■■ 35
PABPC4Q13310 AC068580.4-203ENST00000636397 4038 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.363e-14■■■■■ 35
PABPC4Q13310 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.56e-12■■■■■ 35
PABPC4Q13310 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.36e-12■■■■■ 35
PABPC4Q13310 NFKBIL1-202ENST00000376146 1411 ntTSL 423.16■■□□□ 1.36e-12■■■■■ 35
PABPC4Q13310 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 35
PABPC4Q13310 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -11e-7■■■■■ 35
PABPC4Q13310 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.211e-7■■■■■ 35
PABPC4Q13310 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 35
PABPC4Q13310 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.132e-10■■■■■ 34.9
PABPC4Q13310 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.042e-10■■■■■ 34.9
PABPC4Q13310 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.052e-10■■■■■ 34.9
PABPC4Q13310 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.152e-10■■■■■ 34.9
PABPC4Q13310 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.49e-8■■■■■ 34.9
PABPC4Q13310 CLASRP-208ENST00000587472 345 ntTSL 223.76■■□□□ 1.391e-9■■■■■ 34.9
PABPC4Q13310 CLASRP-214ENST00000591904 506 ntTSL 522.85■■□□□ 1.251e-9■■■■■ 34.9
PABPC4Q13310 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.821e-9■■■■■ 34.9
PABPC4Q13310 CLASRP-206ENST00000585615 633 ntTSL 218.37■□□□□ 0.531e-9■■■■■ 34.9
PABPC4Q13310 CLASRP-210ENST00000588070 445 ntTSL 217.54■□□□□ 0.41e-9■■■■■ 34.9
PABPC4Q13310 CLASRP-202ENST00000391952 2213 ntTSL 1 (best)17.4■□□□□ 0.381e-9■■■■■ 34.9
PABPC4Q13310 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.171e-9■■■■■ 34.9
PABPC4Q13310 ETV5-201ENST00000306376 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.151e-8■■■■■ 34.8
PABPC4Q13310 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.38■■□□□ 1.332e-10■■■■■ 34.8
PABPC4Q13310 LINC00339-207ENST00000634712 1388 ntTSL 518.83■□□□□ 0.613e-16■■■■■ 34.8
PABPC4Q13310 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.273e-16■■■■■ 34.8
PABPC4Q13310 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.123e-16■■■■■ 34.8
PABPC4Q13310 LINC00339-201ENST00000404210 1189 ntBASIC14.33□□□□□ -0.123e-16■■■■■ 34.8
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