Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLN3Q13286 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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