Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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ERCC8Q13216 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
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