Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3BQ13214 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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