Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSMD2Q13200 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSMD2Q13200 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSMD2Q13200 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSMD2Q13200 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD2Q13200 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD2Q13200 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
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