Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKAA1Q13131 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAA1Q13131 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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