Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIF5AQ12840 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIF5AQ12840 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIF5AQ12840 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIF5AQ12840 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIF5AQ12840 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIF5AQ12840 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIF5AQ12840 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF5AQ12840 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms