Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCB1Q12824 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCB1Q12824 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCB1Q12824 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCB1Q12824 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCB1Q12824 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCB1Q12824 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCB1Q12824 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCB1Q12824 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCB1Q12824 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCB1Q12824 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCB1Q12824 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCB1Q12824 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCB1Q12824 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCB1Q12824 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCB1Q12824 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCB1Q12824 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCB1Q12824 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCB1Q12824 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCB1Q12824 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCB1Q12824 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCB1Q12824 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCB1Q12824 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCB1Q12824 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCB1Q12824 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCB1Q12824 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCB1Q12824 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCB1Q12824 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
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