Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC173Q0VFZ6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms