Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PUDPQ08623 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUDPQ08623 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms