Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
GOLGA3Q08378 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
GOLGA3Q08378 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
GOLGA3Q08378 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
GOLGA3Q08378 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
GOLGA3Q08378 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
GOLGA3Q08378 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
GOLGA3Q08378 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
GOLGA3Q08378 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
GOLGA3Q08378 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
GOLGA3Q08378 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
GOLGA3Q08378 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
GOLGA3Q08378 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
GOLGA3Q08378 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
GOLGA3Q08378 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
GOLGA3Q08378 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
GOLGA3Q08378 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
GOLGA3Q08378 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
GOLGA3Q08378 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
GOLGA3Q08378 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
GOLGA3Q08378 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
GOLGA3Q08378 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
GOLGA3Q08378 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
GOLGA3Q08378 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
GOLGA3Q08378 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
GOLGA3Q08378 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC37.52■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.6
GOLGA3Q08378 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.51■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms