Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DDR1Q08345 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms