Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKCDQ05655 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms