Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TLE4Q04727 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms