Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF85Q03923 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF85Q03923 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF85Q03923 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF85Q03923 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF85Q03923 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF85Q03923 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF85Q03923 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF85Q03923 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF85Q03923 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF85Q03923 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF85Q03923 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF85Q03923 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF85Q03923 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF85Q03923 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF85Q03923 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF85Q03923 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF85Q03923 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF85Q03923 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF85Q03923 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF85Q03923 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF85Q03923 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF85Q03923 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF85Q03923 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF85Q03923 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF85Q03923 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF85Q03923 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF85Q03923 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF85Q03923 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms