Protein–RNA interactions for Protein: Q03252

LMNB2, Lamin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2Q03252 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB2Q03252 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMNB2Q03252 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms