Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NUCB1Q02818 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms